植物の環境感覚:刺激受容から細胞応答まで - 文部科学省 科学研究費補助金 新学術領域研究 平成22年度~26年度

山本 義治

2014年度

原著論文

  • Sadhukhan A, Kobayashi Y, Kobayashi Y, Tokizawa M, Yamamoto YY, Iuchi S, Koyama H, Panda SK, and Sahoo L*, VuDREB2A, a novel DREB2-type transcription factor in the drought-tolerant legume cowpea mediates DRE-dependent expression of stress-responsive genes and confers enhanced drought resistance in transgenic Arabidopsis. Planta 240: 645-664. doi: 10.1007/s00425-014-2111-5. (2014.09)
  • Kurihara Y, Makita Y, Kawashima M, Hamasaki H, Yamamoto YY, and Matsui M*. Next-generation sequencing of genomic DNA fragments bound to a transcription factor in vitro reveals its regulatory potential. Genes 5: 1115-1131. doi: 10.3390/genes5041115. (2014.12)
  • Ifuku K, Yan D, Miyahara M, Inoue-Kashino N, Yamamoto YY, and Kashino Y*, A stable and efficient nuclear transformation system for the diatom Chaetoceros gracillis. Photosynth Res 123: 203-211. doi: 10.1007/s11120-014-0048-y. (2015.01)
  • Tokizawa M, Kobayashi Y, Saito T, Kobayashi M, Iuchi S, Nomoto M, Tada Y, Yamamoto YY*, and Koyama H*, STOP1, CAMTA2 and other transcription factors are involved in aluminum-inducible AtALMT1 expression. Plant Physiol doi:10.1104/pp.114.252742. (2015, in press)

受賞

  • 日本土壌肥料学会2014年度年会優秀ポスター賞 中野友貴、大橋聖、楠正隆、時澤睦朋、山本義治、井内聖、小林正智、小山博之、小林佑理子「シロイヌナズナにおけるアルミニウム及び低pH耐性のゲノムワイド関連解析」 日本土壌肥料学会(東京)2014.9.9-11




2013年度

原著論文

  • Hieno A, Naznin HA, Hyakumachi M, Sakurai T, Tokizawa M, Koyama H, Sato N, Nishiyama T, Hasebe M, Zimmer AD, Dang D, Reski R, Rensing S, Obokata J, and Yamamoto YY*, ppdb: Plant Promoter Database ver 3.0. Nucleic Acids Res 42: D1188-1192. doi: 10.1093/nar/gkt1027. (2014.01)

総説・解説・著書

  • Hieno A, Naznin HA, Sawaki K, Koyama H, Sakai Y, Ishino H, Hyakumachi M, Yamamoto YY (2013) Analysis of environmental stress in plants with the aid of marker genes for H2O2 responses. Methods Enzymol 527 , 221-237.

新聞・報道

  • 山本義治 岐阜新聞(朝)2014年1月28日 「研究室から:環境の変化に適応する植物」

受賞などその他

  • ポスター賞:日本光合成学会2013年度大会(2013.6)「光防御関連遺伝子ELIP2プロモーターに含まれる、強光、UV-B、低温ストレス応答を統合する制御配列」速水菜月、坂井優作、 吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、井内聖、小林正智、齋藤竜典、小林佑理子、小山博之、山本義治
  • ポスター賞:日本土壌肥料学会2013年度年会(2013.9)「アルミニウム応答性リンゴ酸トランスポーターALMT1遺伝子の転写制御機構の解析」時澤睦朋、小林安文、小林佑理子、山本義治、小山博之
  • ポスター賞:平成25年度感染生理談話会(2013.8)「植物免疫応答における一酸化窒素応答性因子の同定」三田村梨帆、野元美佳、森毅、時澤睦朋、山本義治、多田安臣(多田先生との共同研究)
  • 特許取得(2013.4)「プロモーター構成配列の抽出法並びに抽出された転写制御配列 」特願2006-168100 発明者 山本義治、市田浩之、阿部知子SEQ-NO 20872、出願国 JP、特許番号 5247009




2012年度

原著論文

  • Maruyama K, Todaka D, Mizoi J, Yoshida T, Kidokoro S, Matsukura S, Takasaki H, Sakurai T, Yamamoto YY, Yoshikawa K, Kojima M, Sakakibara H, Shinozaki K, Yamaguchi-Shinozaki K. (2012) Identification of cis-acting promoter elements in cold- and dehydration-induced transcriptional pathways in Arabidopsis, rice and soybean. DNARes 19: 37-49.

総説・解説・著書

  • Hieno A, Naznin HA, Sawaki K, Koyama H, Sakai Y, Ishino H, Hyakumachi M, Yamamoto YY (in press) Analysis of environmental stress in plants with the aid of marker genes for H2O2 responses. In Methods Enzymol “Hydrogen Peroxide in Cell Signaling” Cadenas E & Packer L (eds).

国際学会(招待講演)

  • Yamamoto YY (2012) Plant promoter analysis in the genomic age. Symposium on Plant Biology and Agrobiotechnology, Beijing, University, China.
  • Yamamoto YY(2012) Arabidopsis Promoter Analysis. Congress of International Plant Biology (ISPMB), Japan-Korea Joint Seminar, Jeju, Korea.




2011年度

原著論文

  • *Yamamoto YY*, Yoshioka Y, Hyakumachi M, and Obokata J. (2011) Characteristics of core promoter types with respect to gene structure and expression in Arabidopsis thaliana. DNA Res, 18: 333-342.
  • *Yamamoto YY*, Yoshioka Y, Hyakumachi M, Maruyama K, Yamaguchi-Shinozaki K, Tokizawa M, Koyama H. (2011) Prediction of transcriptional regulatory elements for plant hormone responses based on microarray data. BMC Plant Biol 11: 39.
  • *Yukawa Y, Dieci G, Alzapiedi M, Hiraga A, Hirai K, Yamamoto YY, Sugiura M. (2011) A common sequence motif involved in selection of transcription start sites of Arabidopsis and budding yeast tRNA genes. Genomics 97: 166-172.

国際学会(招待講演)

  • Yamamoto YY, (2011)“Understanding plant promoters” Lunch Time Seminar, Alberta Innovates - Technology Futures, Vegreville, Alberta, Canada.




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